Plusieurs régions françaises, où le protestantisme a été ou est encore très présent, possèdent un musée présentant des éléments significatifs de l’histoire de la Réforme des origines à nos jours. La plupart d’entre eux sont gérés ou associés à la Société de l’Histoire du Protestantisme Français (S.H.P.F.).

Le plus célèbre des musées français est le musée du Désert à Mialet au Mas Soubeyran. La mémoire protestante est aussi illustrée par quelques monuments commémoratifs.