Cet étage du musée présente les objets liés à la pratique cultuelle ou à la mémoire collective des protestants.

Des notices plus circonstanciées pour chaque objet seront ultérieurement disponibles sur le site du musée. Les salles de ces collections s'enrichiront au fur et à mesure des acquisitions du musée.

À cet étage sont présentées les œuvres d'artistes protestants, qui sont identifiées.
Y figurent des grands noms de l'histoire des arts, comme Jean Goujon, Jacques Androuët du Cerceau, Abraham Bosse, Bernard Palissy, Ary Scheffer, David d'Angers, Auguste Bartholdi.

Les salles de ces collections s'enrichiront au fur et à mesure des acquisitions du musée.